Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms