Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms