Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms