Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 CBR3-AS1-213ENST00000623647 815 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms