Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms