Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
COPS4Q9BT78 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
COPS4Q9BT78 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COPS4Q9BT78 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COPS4Q9BT78 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COPS4Q9BT78 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COPS4Q9BT78 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COPS4Q9BT78 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms