Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms