Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSM1

PCGF1, Polycomb group RING finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF1Q9BSM1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms