Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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GINS3Q9BRX5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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