Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MESP1Q9BRJ9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms