Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms