Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCK3Q9BQ16 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms