Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms