Protein–RNA interactions for Protein: Q99578

RIT2, GTP-binding protein Rit2, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIT2Q99578 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIT2Q99578 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms