Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms