Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
YTHDC1Q96MU7 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
YTHDC1Q96MU7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
YTHDC1Q96MU7 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
YTHDC1Q96MU7 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms