Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms