Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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C9orf85Q96MD7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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C9orf85Q96MD7 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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C9orf85Q96MD7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf85Q96MD7 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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