Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms