Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms