Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRIQ1Q96JM4 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRIQ1Q96JM4 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRIQ1Q96JM4 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRIQ1Q96JM4 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRIQ1Q96JM4 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRIQ1Q96JM4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRIQ1Q96JM4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRIQ1Q96JM4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRIQ1Q96JM4 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRIQ1Q96JM4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRIQ1Q96JM4 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRIQ1Q96JM4 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRIQ1Q96JM4 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRIQ1Q96JM4 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRIQ1Q96JM4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRIQ1Q96JM4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRIQ1Q96JM4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRIQ1Q96JM4 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRIQ1Q96JM4 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRIQ1Q96JM4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRIQ1Q96JM4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRIQ1Q96JM4 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRIQ1Q96JM4 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRIQ1Q96JM4 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRIQ1Q96JM4 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRIQ1Q96JM4 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRIQ1Q96JM4 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRIQ1Q96JM4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRIQ1Q96JM4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRIQ1Q96JM4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRIQ1Q96JM4 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRIQ1Q96JM4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRIQ1Q96JM4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRIQ1Q96JM4 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRIQ1Q96JM4 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRIQ1Q96JM4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRIQ1Q96JM4 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRIQ1Q96JM4 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRIQ1Q96JM4 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRIQ1Q96JM4 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRIQ1Q96JM4 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRIQ1Q96JM4 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRIQ1Q96JM4 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRIQ1Q96JM4 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRIQ1Q96JM4 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRIQ1Q96JM4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRIQ1Q96JM4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRIQ1Q96JM4 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRIQ1Q96JM4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
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