Protein–RNA interactions for Protein: Q96J66

ABCC11, ATP-binding cassette sub-family C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC11Q96J66 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC11Q96J66 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms