Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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