Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC97Q96F63 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms