Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD0

LRRC39, Leucine-rich repeat-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC39Q96DD0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC39Q96DD0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms