Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM3

RPUSD4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase RPUSD4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4Q96CM3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPUSD4Q96CM3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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