Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RUNDC1Q96C34 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms