Protein–RNA interactions for Protein: Q92572

AP3S1, AP-3 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S1Q92572 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3S1Q92572 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3S1Q92572 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3S1Q92572 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3S1Q92572 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3S1Q92572 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3S1Q92572 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3S1Q92572 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3S1Q92572 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3S1Q92572 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3S1Q92572 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3S1Q92572 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3S1Q92572 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3S1Q92572 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3S1Q92572 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3S1Q92572 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3S1Q92572 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3S1Q92572 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3S1Q92572 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3S1Q92572 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3S1Q92572 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3S1Q92572 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3S1Q92572 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3S1Q92572 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3S1Q92572 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3S1Q92572 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3S1Q92572 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3S1Q92572 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3S1Q92572 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3S1Q92572 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3S1Q92572 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3S1Q92572 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3S1Q92572 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3S1Q92572 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3S1Q92572 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3S1Q92572 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3S1Q92572 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3S1Q92572 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3S1Q92572 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3S1Q92572 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3S1Q92572 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3S1Q92572 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3S1Q92572 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3S1Q92572 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3S1Q92572 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms