Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms