Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNDC9Q8TBE3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms