Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTLL11Q8NHH1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms