Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms