Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms