Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms