Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms