Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC84Q86UT8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms