Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMC4Q7Z404 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMC4Q7Z404 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMC4Q7Z404 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMC4Q7Z404 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMC4Q7Z404 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMC4Q7Z404 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMC4Q7Z404 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMC4Q7Z404 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMC4Q7Z404 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMC4Q7Z404 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMC4Q7Z404 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMC4Q7Z404 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMC4Q7Z404 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMC4Q7Z404 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMC4Q7Z404 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMC4Q7Z404 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMC4Q7Z404 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMC4Q7Z404 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC4Q7Z404 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms