Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms