Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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