Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms