Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms