Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY18

LINGO4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO4Q6UY18 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms