Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.942e-7■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 TBC1D7-206ENST00000416436 714 ntTSL 52.85□□□□□ -1.951e-8■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -27e-8■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 HPS5-210ENST00000545561 1121 ntTSL 22.3□□□□□ -2.041e-8■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 BMI1-204ENST00000443519 552 ntTSL 32.09□□□□□ -2.073e-9■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 HSPH1-203ENST00000435381 812 ntTSL 41.74□□□□□ -2.133e-16■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 ENY2-216ENST00000523707 737 ntTSL 50.21□□□□□ -2.383e-16■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-1.57□□□□□ -2.663e-16■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.168e-7■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 BIRC2-207ENST00000531259 572 ntTSL 514.57□□□□□ -0.088e-7■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.458e-7■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.668e-7■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 BIRC2-213ENST00000613397 4066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.718e-7■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 BIRC2-204ENST00000527910 4073 ntTSL 1 (best)9.64□□□□□ -0.878e-7■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 BIRC2-201ENST00000227758 3743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.928e-7■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 RYK-204ENST00000480381 541 ntTSL 50.94□□□□□ -2.266e-10■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 ATP6V0A1-218ENST00000588629 1797 ntTSL 215.71■□□□□ 0.113e-6■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 RAD54L-202ENST00000442598 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.142e-7■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 RAD54L-201ENST00000371975 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.212e-7■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 MRPL16-204ENST00000534340 574 ntTSL 37.47□□□□□ -1.213e-9■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 MRPL16-202ENST00000525470 922 ntTSL 53.66□□□□□ -1.823e-9■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.223e-7■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 RCC1L-203ENST00000615250 592 ntTSL 412.16□□□□□ -0.463e-7■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.035e-15■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.075e-15■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 SRSF2-204ENST00000452355 1357 ntTSL 513.58□□□□□ -0.245e-15■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 SRSF2-208ENST00000585202 1359 ntTSL 312.28□□□□□ -0.445e-15■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.695e-15■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 MYH9-211ENST00000495928 329 ntTSL 210.53□□□□□ -0.722e-7■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 GNL3-205ENST00000468146 533 ntTSL 48.62□□□□□ -1.034e-7■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 GNL3-208ENST00000479230 547 ntTSL 42.58□□□□□ -24e-7■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 USP39-208ENST00000455732 623 ntTSL 314.86□□□□□ -0.039e-10■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 USP39-211ENST00000465282 568 ntTSL 414.23□□□□□ -0.139e-10■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 USP39-205ENST00000442708 561 ntTSL 413.4□□□□□ -0.269e-10■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 USP39-217ENST00000491659 648 ntTSL 312.87□□□□□ -0.359e-10■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 USP39-206ENST00000448971 610 ntTSL 312.6□□□□□ -0.399e-10■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 FBXO38-206ENST00000503613 627 ntTSL 38.52□□□□□ -1.056e-8■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 FBXO38-211ENST00000508326 745 ntTSL 28.2□□□□□ -1.16e-8■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 FBXO38-220ENST00000521160 590 ntTSL 46.71□□□□□ -1.336e-8■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 RPL14-204ENST00000435633 966 ntTSL 218.67■□□□□ 0.584e-9■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.444e-9■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.584e-9■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 RPL14-208ENST00000479563 794 ntTSL 1 (best)10.29□□□□□ -0.769e-9■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.574e-9■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 RPL14-209ENST00000481798 604 ntTSL 34.42□□□□□ -1.79e-9■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 STT3A-213ENST00000531001 325 ntTSL 35.3□□□□□ -1.563e-25■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 RAD23B-203ENST00000419616 716 ntTSL 316.01■□□□□ 0.152e-8■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 RAD23B-204ENST00000442587 456 ntTSL 24.15□□□□□ -1.742e-8■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 LRP5L-206ENST00000474163 814 ntTSL 513.63□□□□□ -0.231e-7■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 LRP5L-208ENST00000610821 3602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.91e-7■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 LRP5L-204ENST00000467672 3605 ntTSL 1 (best)9.05□□□□□ -0.961e-7■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 FOXM1-208ENST00000538564 693 ntTSL 37.12□□□□□ -1.271e-8■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 USP48-203ENST00000374732 3037 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.63e-9■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 DHX35-204ENST00000449559 607 ntTSL 38.31□□□□□ -1.085e-7■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 ATF2-215ENST00000435004 1115 ntTSL 55.45□□□□□ -1.541e-7■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.941e-7■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 DESI1-202ENST00000463886 1088 ntTSL 27.29□□□□□ -1.241e-33■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 DESI1-204ENST00000482612 451 ntTSL 26.86□□□□□ -1.311e-33■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.519e-9■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 PHF8-207ENST00000415025 687 ntTSL 314.34□□□□□ -0.112e-8■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 PHF8-210ENST00000437224 555 ntTSL 412.9□□□□□ -0.342e-8■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 PRKCSH-219ENST00000593101 578 ntTSL 412.66□□□□□ -0.385e-16■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 PHF8-214ENST00000453905 534 ntTSL 412.12□□□□□ -0.472e-8■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 PHF8-212ENST00000445025 475 ntTSL 411.82□□□□□ -0.522e-8■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 PHF8-209ENST00000433120 555 ntTSL 411.82□□□□□ -0.522e-8■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 PRKCSH-218ENST00000593053 588 ntTSL 511.13□□□□□ -0.635e-16■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 PRKCSH-206ENST00000587509 545 ntTSL 49.98□□□□□ -0.815e-16■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 SERPINF1-208ENST00000572517 672 ntTSL 29.89□□□□□ -0.832e-23■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 PRKCSH-220ENST00000593104 545 ntTSL 49.83□□□□□ -0.845e-16■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 PHF8-208ENST00000425862 565 ntTSL 49.19□□□□□ -0.942e-8■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 GGA1-219ENST00000481613 647 ntTSL 29.14□□□□□ -0.952e-8■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 EXOC7-209ENST00000442951 583 ntTSL 28.58□□□□□ -1.042e-8■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 WDR45-225ENST00000486337 422 ntTSL 57.98□□□□□ -1.132e-8■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 MTFR1L-214ENST00000497956 2531 ntTSL 26.6□□□□□ -1.352e-8■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.532e-8■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.93e-7■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.063e-7■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.153e-7■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.243e-7■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.273e-7■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 NQO2-207ENST00000397717 833 ntTSL 514.25□□□□□ -0.133e-8■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 NQO2-206ENST00000380472 689 ntTSL 510.05□□□□□ -0.83e-8■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.311e-7■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 PIKFYVE-207ENST00000452564 4214 ntTSL 25.84□□□□□ -1.472e-6■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 RECQL4-205ENST00000532846 1055 ntTSL 514□□□□□ -0.171e-7■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.383e-6■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 LARGE1-202ENST00000397394 4138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.613e-6■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.613e-6■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.382e-8■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 RAD54L2-205ENST00000487093 4782 ntTSL 58.75□□□□□ -1.012e-7■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 RAD54L2-201ENST00000409535 9776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.12e-7■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 ADH5-204ENST00000503130 786 ntTSL 38.04□□□□□ -1.121e-7■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 ADH5-208ENST00000508511 1909 ntTSL 27.94□□□□□ -1.141e-7■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 SPDYA-205ENST00000462832 2081 ntTSL 23.5□□□□□ -1.852e-7■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 UBAP2-207ENST00000421278 833 ntTSL 54.38□□□□□ -1.715e-21■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.314e-13■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 BCL3-208ENST00000477832 385 ntTSL 314.96□□□□□ -0.017e-7■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.521e-9■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 AVL9-202ENST00000409301 4336 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.741e-9■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 AVL9-203ENST00000446718 6372 ntTSL 55.9□□□□□ -1.461e-9■■■■■ 32.1
Retrieved 100 of 73,762 protein–RNA pairs in 515.9 ms