Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms