Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATL3Q6DD88 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATL3Q6DD88 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms