Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms