Protein–RNA interactions for Protein: Q63HK3

ZKSCAN2, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 2, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN2Q63HK3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZKSCAN2Q63HK3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms