Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms