Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF20Q5VTR2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms