Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms